Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00303Q3SY05 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms