Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010894.2-201ENST00000444196 561 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 TROAP-209ENST00000549275 348 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 TROAP-210ENST00000549534 839 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms