Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms