Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms