Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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CCDC96Q2M329 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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CCDC96Q2M329 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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CCDC96Q2M329 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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