Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHB4

SLC5A12, Sodium-coupled monocarboxylate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A12Q1EHB4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A12Q1EHB4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms