Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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