Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP2B3Q16720 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms