Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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