Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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ECM1Q16610 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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ECM1Q16610 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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ECM1Q16610 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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ECM1Q16610 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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ECM1Q16610 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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ECM1Q16610 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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ECM1Q16610 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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ECM1Q16610 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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