Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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