Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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SCN9AQ15858 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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SCN9AQ15858 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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SCN9AQ15858 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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SCN9AQ15858 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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SCN9AQ15858 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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