Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF2Q15853 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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