Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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