Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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