Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AC016590.1-201ENST00000588763 420 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 TAC3-209ENST00000458521 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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