Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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UBE3CQ15386 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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