Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms