Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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