Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms