Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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SMCO1Q147U7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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