Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTTNQ14247 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms