Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms