Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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