Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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ITGA7Q13683 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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ITGA7Q13683 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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ITGA7Q13683 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms