Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms