Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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