Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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