Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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TRAF2Q12933 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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TRAF2Q12933 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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TRAF2Q12933 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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TRAF2Q12933 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
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TRAF2Q12933 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
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