Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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PTPN13Q12923 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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PTPN13Q12923 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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PTPN13Q12923 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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PTPN13Q12923 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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PTPN13Q12923 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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PTPN13Q12923 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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