Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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