Protein–RNA interactions for Protein: Q12834

CDC20, Cell division cycle protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC20Q12834 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC20Q12834 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms