Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SREBF2Q12772 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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