Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms