Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms