Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms