Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP1Q04837 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP1Q04837 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP1Q04837 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP1Q04837 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP1Q04837 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP1Q04837 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP1Q04837 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms