Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms