Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms