Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XPCQ01831 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XPCQ01831 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XPCQ01831 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XPCQ01831 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XPCQ01831 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XPCQ01831 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XPCQ01831 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XPCQ01831 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XPCQ01831 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XPCQ01831 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XPCQ01831 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XPCQ01831 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XPCQ01831 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XPCQ01831 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
XPCQ01831 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
XPCQ01831 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
XPCQ01831 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
XPCQ01831 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
XPCQ01831 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XPCQ01831 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XPCQ01831 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XPCQ01831 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XPCQ01831 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XPCQ01831 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XPCQ01831 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XPCQ01831 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XPCQ01831 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XPCQ01831 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XPCQ01831 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XPCQ01831 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XPCQ01831 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XPCQ01831 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XPCQ01831 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XPCQ01831 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XPCQ01831 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XPCQ01831 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XPCQ01831 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XPCQ01831 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XPCQ01831 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XPCQ01831 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XPCQ01831 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XPCQ01831 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XPCQ01831 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XPCQ01831 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XPCQ01831 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XPCQ01831 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XPCQ01831 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XPCQ01831 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XPCQ01831 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XPCQ01831 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XPCQ01831 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XPCQ01831 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
XPCQ01831 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XPCQ01831 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XPCQ01831 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XPCQ01831 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XPCQ01831 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XPCQ01831 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XPCQ01831 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XPCQ01831 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XPCQ01831 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XPCQ01831 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XPCQ01831 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XPCQ01831 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
XPCQ01831 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XPCQ01831 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XPCQ01831 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XPCQ01831 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XPCQ01831 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XPCQ01831 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XPCQ01831 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
XPCQ01831 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XPCQ01831 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
XPCQ01831 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XPCQ01831 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XPCQ01831 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
XPCQ01831 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XPCQ01831 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XPCQ01831 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XPCQ01831 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XPCQ01831 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XPCQ01831 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XPCQ01831 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XPCQ01831 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XPCQ01831 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XPCQ01831 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XPCQ01831 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XPCQ01831 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XPCQ01831 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XPCQ01831 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XPCQ01831 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XPCQ01831 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XPCQ01831 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XPCQ01831 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XPCQ01831 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
XPCQ01831 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XPCQ01831 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XPCQ01831 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
XPCQ01831 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms