Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms