Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms