Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.4 ms