Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms