Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms