Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIM1P81133 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms