Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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