Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP1P63208 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP1P63208 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP1P63208 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP1P63208 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP1P63208 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP1P63208 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP1P63208 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP1P63208 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP1P63208 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP1P63208 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP1P63208 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP1P63208 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP1P63208 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP1P63208 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP1P63208 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP1P63208 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP1P63208 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP1P63208 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP1P63208 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP1P63208 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP1P63208 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP1P63208 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP1P63208 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP1P63208 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP1P63208 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP1P63208 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP1P63208 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP1P63208 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP1P63208 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP1P63208 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP1P63208 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP1P63208 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP1P63208 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP1P63208 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP1P63208 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKP1P63208 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SKP1P63208 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SKP1P63208 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SKP1P63208 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SKP1P63208 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SKP1P63208 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SKP1P63208 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms