Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFM1P61960 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFM1P61960 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms