Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms